1995年,进入台湾必治妥施贵宝公司。
2006年,加入雀巢,担任雀巢中国高级副总裁、雀巢大中华区营养业务区域负责人。
2014年3月,加入荷兰皇家菲仕兰,担任菲仕兰大中华区董事长及首席执行官。
2016年10月1日起,出任雅培营养品部北亚区总裁。
2018年12月20日,不再担任雅培营养品部北亚区总裁一职。
2019年11月14日,邱肇祥出任通用磨坊中国区总裁兼董事总经理,该任命于11月19日正式生效。
担任乳制品工业协会理事,中荷奶业发展中心监事会主席。