云南医药健康职业学院现有昆明和安宁两大校区，基础建设投资达 6 亿元，教学科研仪器价值 7000 万余元。截至2023年，建有实验实训室 129 间，拥有专业的基础实验（训）中心、口腔医学实验（训）中心等多个实验室。

学校设有口腔医学（临床医学类）、临床医学（临床医学类）、针灸推拿（临床医学类）、口腔医学技术、医学检验技术、医学影像技术、护理、中药学和康复治疗技术、体育保健与康复等专科专业。

学校建有现代化教学楼、图书馆、体育馆、标准田径运动场和设备先进的医学实验中心，校外实践教学基地230家，其中附属医院3家、教学医院2家、实习基地131家、实习医院89家、产学研合作单位5家。现已形成了“校院一体、医教融合”的办学特色，为学生实训、实习、就业提供了可靠保障。

云南医药健康职业学院为在校学生搭建良好的升学平台，让广大学子在获得优质教学资源的同时，可通过“专升本”、“成教本科”和“出国留学”的方式提升学历。学校以人为本，以学生为中心，积极为毕业学生提供就业指导和就业服务，积极开拓就业市场，保障毕业生实现就业。学校还提供奖助医保服务，设立“翰文教育助学金”，为品学兼优和家庭经济困难的学生提供资助。