北京市第四十三中学创建于1947年6月19日，前身系北京私立惜阴中学。初建时校址在和平门外西琉璃厂八角琉璃井3号，占地6.25亩。学校教学设备已经日臻完善，闭路电视、校园网、宽带进入每一个教室，且教室内都装备了多媒体投影教学设备。学校有现代化的理化生实验室，计算机专用教室，学生阅览室，多媒体教室，电视演播室，多功能厅，教师电子备课室、数字实验室、通用技术专业教室等现代化教学设备。

四十三中是北京市艺术特色学校，学校在初中开设了声乐、管乐和艺术特长班，为学校的艺术特长培养奠定了基础；学校每年都有自己的艺术节、体育节、科技节，美育奇葩正绚丽绽放。学校师生丰富多彩的艺术活动已经成为学校对内凝聚人心、人气的载体、对外彰显学校的特色业绩的重要窗口。学校是中国西部教育顾问单位、首都精神文明单位、北京市文明礼仪示范学校、北京市共青团达标创优竞赛五四红旗团委、北京市中小学艺术教育特色学校、北京市健康促进学校、北京市优秀教职工之家。

四十三中学拥有一支勤奋敬业、业务精良、梯度合理的教师队伍，严谨的校风建设、稳定优良的教育教学质量使得四十三中虽为普通校却跻身于北京市百所名校的行列。学校的市、区、校骨干教师占专任教师总数的30%。多人、多次在全国、北京市、宣武区教学评优课、教学基本技能大赛中获奖。其中七个教研组先后被评为市、区优秀教研组；有20位教师曾荣获“紫禁杯优秀班主任”称号，其中一人获特等奖。

1949年1月31日北平解放，人民政府接管了惜阴中学，成立了新一届董事会，推举张长序为第二任惜阴中学校长。

1952年9月23日，北京市政府将惜阴中学收编为国有市立中学，并颁名为“北京市第四十三中学”，当时的彭真市长亲自任命张长序为北京市第四十三中学校长，张世龄为教导主任。

1960年四十三中学被评为“北京市红旗单位”。

党的十一届三中全会以来，随着党的工作重心的转移，广大教师继承和发扬了四十三中艰苦奋斗的优良传统，工作不断进取，1978年被确定为北京市田径、篮球传统校。

学校1998年被命名为“北京市艺术传统校”。

2001年4月被市区政府外事办确定为“北京市重点对外参观单位”。