截至2023年3月，长春中医药大学占地面积57.1万㎡。学校设有5个学科门类，以中医药为主，医、工、管、法、文等多学科协调发展，有一级学科博士后流动站2个，一级学科博士学位授权点2个、二级学科博士学位授权点25个，博士专业学位授权点1个，一级学科硕士学位授权点6个、二级学科硕士学位授权点41个，硕士专业学位授权点5个。现有国家中医药管理局重点学科19个，吉林省特色高水平学科4个，吉林省“世界一流学科培育计划”立项建设学科1个。学校设有本科专业23个，其中国家级一流专业建设点7个，国家级特色专业建设点4个，国家级专业综合改革试点专业1个，省级特色专业8个。有国家级人才培养模式创新实验区1个，国家级虚拟教研室建设试点1个、分教研室1个。有国家级一流本科课程12门，国家级课程思政示范课1门，国家级精品资源共享课2门，国家级精品课程3门，国家级虚拟仿真实验教学项目2项，国家级课程思政教学团队1个。主编规划教材67部，获评首届全国教材建设奖先进个人1人，首届全国教材建设优秀教材二等奖2项。获得国家级教学成果奖2项，吉林省教学成果特等奖1项。

1950年，长春市立中医进修学校成立。

1958年，在吉林省中医进修学校基础上成立长春中医学院。

1962年，吉林省卫生干部学校并入学校。

1970年，学校并入了吉林医科大学。

1978年，从吉林医科大学中独立出来，恢复长春中医学院建制，原全国人大常委会副委员长、中国科学院院长郭沫若为学校题写了校名。

2000年，吉林省职工医科大学和长春中医学院附属卫生学校并入学校。

2002年，长春中医药大学净月校区一期工程胜利竣工，学校主体迁入净月校区。

2003年，国务院学位委员会批准该校成为博士学位授权单位。

2004年，吉林省人民政府确定该校为省属重点高校。

2006年，获教育部批准，长春中医学院更名为长春中医药大学。

2012年，学校获得了国家中西部高校基础能力建设工程项目。

2018年10月，学校成为吉林省人民政府与国家中医药管理局共建高校。

2020年3月，入选吉林省特色高水平大学建设项目高校。

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