麝香龟背甲上具有棱突（幼体尤为明显），椎盾呈覆瓦状；棕色或橙色，接缝处有深色的镶边；可能有深色的点状或辐射条纹状的图案。腹甲小，粉红色或黄色，有一个不甚明显的铰链关节，和单枚的喉盾。仅在下巴上长有触须。头部有深色的斑点或条纹。雄性具有末端呈刺状的大尾巴；而雌性尾巴的末端，仅只刚刚能够到背甲的边缘。

麝香龟是典型的杂食性动物，举凡植物、甲壳类、小鱼、昆虫甚至是动物残骸等无所不吃。不过它们的觅食主要是在水底的污泥上进行，因为它们是极少离开水面的。麝香龟的名字来自于此类龟的一个共同的特性，当它们受到惊扰时都会由射香腺释放出一种味道刺鼻的液体，以吓阻略食者，而且雄龟也特别具有攻击性。麝香龟是属于夜行性的龟类，白天多埋身泥底休息到黄昏时才开始活动，觅食通常不会游泳而是在水底行走长时间生活在水底，也造成龟壳上长满藻类，当温度低于10°C时它们会进入水底污泥中冬眠。